Onderzoekers van KU Leuven tonen aan dat een nieuwe analysetechniek honderden virussen tegelijk kan opsporen in rioolwater. De methode brengt niet alleen in kaart welke virussen circuleren, maar onderscheidt ook verschillende virusvarianten en kan veranderingen in viruscirculatie bij de bevolking vroeg signaleren.
Rioolwater wordt al langer gebruikt om de verspreiding van virussen op te volgen. Die monitoring gebeurt meestal door gerichte PCR-testen die zoeken naar een beperkt aantal vooraf geselecteerde ziekteverwekkers. Onderzoekers van KU Leuven onderzochten of het mogelijk is om veel meer virussen tegelijk op te volgen.
Daarvoor analyseerden ze gedurende meer dan 2,5 jaar wekelijks rioolwater uit Leuven. De stalen kwamen van een waterzuiveringsinstallatie van Aquafin die afvalwater verwerkt van zo’n 120.000 inwoners. De onderzoekers gebruikten de hybrid-capture metagenomics-techniek die genetisch materiaal van virussen eerst selectief uit een staal haalt, als naalden uit een hooiberg. Daardoor kunnen ze heel veel verschillende virussen tegelijk opsporen – ook al zijn ze maar in lage concentraties aanwezig – en tegelijk voldoende genetisch detail verzamelen om verschillende varianten van één virus van elkaar te onderscheiden.
Met die aanpak vonden ze gedurende de hele periode 339 verschillende virussoorten en 715 virusstammen. Naast onder meer rota-, noro- en adenovirussen detecteerden ze ook virussen die minder routinematig worden opgevolgd. De resultaten toonden – zoals verwacht – ook seizoensgebonden veranderingen: sommige virussen kwamen vooral voor in de winter en het voorjaar, andere vaker in de zomer.
Lees het hele bericht op de site van de KU Leuven.
